NộI Dung

• Tổng quan về phần mềm
• Các loại tệp được hỗ trợ
• Mở rộng tập tin chính
• Các phần mở rộng tệp khác được Trình duyệt bộ gen tích hợp 9 sử dụng

Phiên bản (tính đến ngày 29/6/2016)	9
Nền tảng
Giấy phép	Mã nguồn mở
thể loại	Thuộc về khoa học

Thông tin thêm (truy cập trang web của nhà xuất bản)

Xêp hạng: 2.8 / 5 (6 phiếu)

Tổng quan về phần mềm

Những đặc điểm chính

• Hỗ trợ các định dạng bộ gen khác nhau như GenBank và FASTA
• Tương tác với dữ liệu với hình động phóng to và xoay
• Truy cập và tải bộ gen từ các trang web QuickLoad
• Chuyển đổi dữ liệu thành các dạng biểu đồ khác nhau
• Chia sẻ dữ liệu với cộng tác viên thông qua Dropbox
• Cài đặt plugin cho chức năng bổ sung

Trình duyệt bộ gen tích hợp (IGB) là một chương trình nguồn mở được sử dụng để xem và khám phá các bộ dữ liệu bộ gen lớn. Bạn có thể xem các định dạng dữ liệu khác nhau, tương tác với dữ liệu của bạn, tạo biểu đồ, lưu thông tin của bạn dưới dạng hình ảnh và chia sẻ dữ liệu của bạn với cộng tác viên.

IGB cho phép bạn xem dữ liệu từ các chú thích và các chuỗi được căn chỉnh. Chương trình hỗ trợ nhiều định dạng như FASTA, BAM, BEDGRAPH, BigWIG, Cytoband và GenBank. Bạn có thể lấy dữ liệu và chuyển đổi nó thành nhiều dạng biểu đồ bao gồm các biểu đồ không khớp để làm nổi bật sự khác biệt dữ liệu và biểu đồ độ sâu để hiển thị phạm vi. Bạn cũng có thể tương tác với dữ liệu của mình thông qua hoạt ảnh phóng to và xoay của IGB.

IGB cho phép bạn truy cập và tải bộ gen từ các trang QuickLoad, là các hệ thống đơn giản của các thư mục, trình tự và các tệp dữ liệu khác cho mục đích trực quan hóa. IGB cung cấp chức năng nâng cao với hỗ trợ plugin để thêm chức năng và tự động hóa quy trình làm việc thông qua việc sử dụng các tập lệnh. IGB cũng cung cấp cho bạn các tính năng nâng cao để chia sẻ dữ liệu của bạn, cho dù đó là xuất bản dưới dạng hình ảnh JPEG, PNG hoặc SVG chất lượng cao hoặc lưu trữ dữ liệu trong Dropbox để cho cộng tác viên của bạn truy cập vào dự án của bạn.

IGB chủ yếu được sử dụng bởi các nhà nghiên cứu đại học, nhà sinh học và nhà sinh học. Nó cung cấp các công cụ nâng cao để mở nhiều định dạng dữ liệu bộ gen, trực quan hóa dữ liệu dưới dạng biểu đồ khác nhau và chia sẻ dữ liệu với cộng tác viên. Thật không may, chương trình dựa vào các khoản tài trợ để tiếp tục phát triển, điều đó có nghĩa là việc hỗ trợ cho ứng dụng có thể chấm dứt bất cứ lúc nào. Tuy nhiên, Trình duyệt bộ gen tích hợp vẫn là một chương trình có khả năng tùy biến cho người dùng muốn khám phá và phân tích dữ liệu bộ gen của họ.

Các loại tệp được hỗ trợ

Mở rộng tập tin chính

.XML - Tệp XML

Các phần mở rộng tệp khác được Trình duyệt bộ gen tích hợp 9 sử dụng

Các loại tệp được hỗ trợ
.GIƯỜNG	Tệp theo dõi chú thích của UCSC BED
.DAS	Phiên phân tích DeltaMaster
.A	FASTA Định dạng tệp trình tự
.Có	Tập tin trình tự FASTA
.	Tập tin trình tự FASTA
.GB	Tệp dữ liệu GenBank
.SGR	Tệp dữ liệu bộ gen SGR
.USEQ	Tệp dữ liệu bộ gen USeq